Protein–RNA interactions for Protein: Q92791

P3H4, Endoplasmic reticulum protein SC65, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H4Q92791 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P3H4Q92791 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P3H4Q92791 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
P3H4Q92791 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms