Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SFT2D1Q8WV19 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms