Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF17

SH3TC2, SH3 domain and tetratricopeptide repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3TC2Q8TF17 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3TC2Q8TF17 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SH3TC2Q8TF17 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3TC2Q8TF17 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3TC2Q8TF17 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3TC2Q8TF17 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3TC2Q8TF17 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3TC2Q8TF17 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3TC2Q8TF17 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3TC2Q8TF17 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3TC2Q8TF17 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SH3TC2Q8TF17 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms