Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms