Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CARMIL3Q8ND23 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CARMIL3Q8ND23 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms