Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
CNBD1Q8NA66 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms