Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V2

TRIML1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML1Q8N9V2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms