Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC89Q8N998 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms