Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
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