Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NPM2Q86SE8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NPM2Q86SE8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NPM2Q86SE8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NPM2Q86SE8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NPM2Q86SE8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NPM2Q86SE8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NPM2Q86SE8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NPM2Q86SE8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NPM2Q86SE8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NPM2Q86SE8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NPM2Q86SE8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NPM2Q86SE8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NPM2Q86SE8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NPM2Q86SE8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NPM2Q86SE8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NPM2Q86SE8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NPM2Q86SE8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPM2Q86SE8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms