Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CATSPER4Q7RTX7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CATSPER4Q7RTX7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms