Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0L9

Transmembrane protein LOC653160, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q7L0L9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q7L0L9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q7L0L9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q7L0L9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q7L0L9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q7L0L9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q7L0L9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q7L0L9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q7L0L9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q7L0L9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q7L0L9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q7L0L9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q7L0L9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q7L0L9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q7L0L9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q7L0L9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q7L0L9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q7L0L9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q7L0L9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q7L0L9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q7L0L9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q7L0L9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q7L0L9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q7L0L9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q7L0L9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q7L0L9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q7L0L9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q7L0L9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q7L0L9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q7L0L9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q7L0L9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q7L0L9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q7L0L9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q7L0L9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q7L0L9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q7L0L9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Q7L0L9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q7L0L9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q7L0L9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q7L0L9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q7L0L9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q7L0L9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q7L0L9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q7L0L9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q7L0L9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q7L0L9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Q7L0L9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Q7L0L9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q7L0L9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q7L0L9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q7L0L9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q7L0L9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q7L0L9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q7L0L9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q7L0L9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q7L0L9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q7L0L9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Q7L0L9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q7L0L9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q7L0L9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q7L0L9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q7L0L9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q7L0L9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q7L0L9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q7L0L9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q7L0L9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Q7L0L9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q7L0L9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q7L0L9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q7L0L9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q7L0L9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q7L0L9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q7L0L9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q7L0L9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q7L0L9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q7L0L9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q7L0L9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q7L0L9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q7L0L9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q7L0L9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q7L0L9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q7L0L9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q7L0L9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q7L0L9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q7L0L9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Q7L0L9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q7L0L9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q7L0L9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q7L0L9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Q7L0L9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q7L0L9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q7L0L9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q7L0L9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q7L0L9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q7L0L9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q7L0L9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q7L0L9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q7L0L9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q7L0L9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q7L0L9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms