Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf47Q6ZRZ4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf47Q6ZRZ4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms