Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYNE3Q6ZMZ3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNE3Q6ZMZ3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms