Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPTNQ6XPR3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms