Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNT2Q6UVM3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNT2Q6UVM3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms