Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NANOGP8Q6NSW7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NANOGP8Q6NSW7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms