Protein–RNA interactions for Protein: Q6L9W6

B4GALNT3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT3Q6L9W6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
B4GALNT3Q6L9W6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms