Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF6Q6KF10 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GDF6Q6KF10 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms