Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
CARMIL2Q6F5E8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CARMIL2Q6F5E8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CARMIL2Q6F5E8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms