Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG16L1Q676U5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG16L1Q676U5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG16L1Q676U5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms