Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GGNBP1Q5YKI7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms