Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
USPL1Q5W0Q7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms