Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CELF3Q5SZQ8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CELF3Q5SZQ8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms