Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP188Q5SRE5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NUP188Q5SRE5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms