Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms