Protein–RNA interactions for Protein: Q5R3I4

TTC38, Tetratricopeptide repeat protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC38Q5R3I4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTC38Q5R3I4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms