Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HSD17B12Q53GQ0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HSD17B12Q53GQ0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HSD17B12Q53GQ0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms