Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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KRTAP21-3Q3LHN1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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KRTAP21-3Q3LHN1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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KRTAP21-3Q3LHN1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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KRTAP21-3Q3LHN1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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KRTAP21-3Q3LHN1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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KRTAP21-3Q3LHN1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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KRTAP21-3Q3LHN1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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KRTAP21-3Q3LHN1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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KRTAP21-3Q3LHN1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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