Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAY7

SMU1, WD40 repeat-containing protein SMU1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMU1Q2TAY7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMU1Q2TAY7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMU1Q2TAY7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMU1Q2TAY7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMU1Q2TAY7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMU1Q2TAY7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMU1Q2TAY7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMU1Q2TAY7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMU1Q2TAY7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMU1Q2TAY7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMU1Q2TAY7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMU1Q2TAY7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMU1Q2TAY7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMU1Q2TAY7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMU1Q2TAY7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMU1Q2TAY7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMU1Q2TAY7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMU1Q2TAY7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMU1Q2TAY7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMU1Q2TAY7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMU1Q2TAY7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMU1Q2TAY7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms