Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NRF1Q16656 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NRF1Q16656 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms