Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDB1Q16531 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DDB1Q16531 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDB1Q16531 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms