Protein–RNA interactions for Protein: Q15345

LRRC41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC41Q15345 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC41Q15345 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC41Q15345 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms