Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX17Q15036 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
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