Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCLAFQ15004 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCLAFQ15004 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms