Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DSC3Q14574 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DSC3Q14574 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms