Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GBX1Q14549 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GBX1Q14549 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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