Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SQLEQ14534 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SQLEQ14534 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SQLEQ14534 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SQLEQ14534 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SQLEQ14534 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SQLEQ14534 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SQLEQ14534 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SQLEQ14534 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SQLEQ14534 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SQLEQ14534 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SQLEQ14534 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SQLEQ14534 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SQLEQ14534 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SQLEQ14534 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SQLEQ14534 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SQLEQ14534 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SQLEQ14534 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SQLEQ14534 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SQLEQ14534 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SQLEQ14534 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SQLEQ14534 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SQLEQ14534 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SQLEQ14534 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SQLEQ14534 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SQLEQ14534 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SQLEQ14534 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SQLEQ14534 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SQLEQ14534 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SQLEQ14534 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SQLEQ14534 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SQLEQ14534 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SQLEQ14534 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SQLEQ14534 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SQLEQ14534 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SQLEQ14534 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SQLEQ14534 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SQLEQ14534 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SQLEQ14534 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SQLEQ14534 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SQLEQ14534 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SQLEQ14534 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
SQLEQ14534 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SQLEQ14534 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SQLEQ14534 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SQLEQ14534 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SQLEQ14534 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SQLEQ14534 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SQLEQ14534 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SQLEQ14534 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SQLEQ14534 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SQLEQ14534 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SQLEQ14534 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SQLEQ14534 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SQLEQ14534 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SQLEQ14534 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SQLEQ14534 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SQLEQ14534 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SQLEQ14534 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SQLEQ14534 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SQLEQ14534 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SQLEQ14534 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SQLEQ14534 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SQLEQ14534 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SQLEQ14534 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SQLEQ14534 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SQLEQ14534 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SQLEQ14534 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SQLEQ14534 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SQLEQ14534 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SQLEQ14534 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SQLEQ14534 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SQLEQ14534 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SQLEQ14534 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SQLEQ14534 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SQLEQ14534 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SQLEQ14534 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SQLEQ14534 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SQLEQ14534 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SQLEQ14534 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SQLEQ14534 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
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