Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCN5AQ14524 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCN5AQ14524 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN5AQ14524 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms