Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP5Q14008 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKAP5Q14008 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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