Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PDE3BQ13370 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PDE3BQ13370 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
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