Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGCGQ13326 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGCGQ13326 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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