Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATMQ13315 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATMQ13315 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATMQ13315 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATMQ13315 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATMQ13315 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATMQ13315 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATMQ13315 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATMQ13315 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATMQ13315 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATMQ13315 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATMQ13315 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATMQ13315 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATMQ13315 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATMQ13315 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATMQ13315 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATMQ13315 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATMQ13315 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATMQ13315 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATMQ13315 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATMQ13315 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATMQ13315 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATMQ13315 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATMQ13315 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATMQ13315 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATMQ13315 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATMQ13315 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATMQ13315 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATMQ13315 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATMQ13315 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATMQ13315 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATMQ13315 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATMQ13315 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATMQ13315 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATMQ13315 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATMQ13315 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATMQ13315 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATMQ13315 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATMQ13315 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATMQ13315 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATMQ13315 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATMQ13315 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATMQ13315 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATMQ13315 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATMQ13315 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATMQ13315 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATMQ13315 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATMQ13315 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATMQ13315 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATMQ13315 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATMQ13315 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATMQ13315 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATMQ13315 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATMQ13315 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATMQ13315 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATMQ13315 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATMQ13315 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATMQ13315 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATMQ13315 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATMQ13315 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATMQ13315 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATMQ13315 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATMQ13315 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATMQ13315 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATMQ13315 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATMQ13315 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATMQ13315 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATMQ13315 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATMQ13315 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATMQ13315 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATMQ13315 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATMQ13315 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATMQ13315 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATMQ13315 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATMQ13315 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATMQ13315 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATMQ13315 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATMQ13315 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATMQ13315 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATMQ13315 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATMQ13315 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATMQ13315 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATMQ13315 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATMQ13315 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATMQ13315 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATMQ13315 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATMQ13315 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATMQ13315 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATMQ13315 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATMQ13315 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATMQ13315 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATMQ13315 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATMQ13315 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATMQ13315 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATMQ13315 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATMQ13315 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATMQ13315 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATMQ13315 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATMQ13315 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATMQ13315 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
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