Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
CBX3Q13185 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CBX3Q13185 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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