Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXF2Q12947 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXF2Q12947 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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