Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCB1Q12824 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMARCB1Q12824 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
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