Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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GTF3C1Q12789 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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GTF3C1Q12789 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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GTF3C1Q12789 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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GTF3C1Q12789 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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GTF3C1Q12789 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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GTF3C1Q12789 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GTF3C1Q12789 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF3C1Q12789 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF3C1Q12789 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GTF3C1Q12789 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C1Q12789 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C1Q12789 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C1Q12789 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C1Q12789 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GTF3C1Q12789 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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