Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 RIB4YOL143C 510 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 UTP23YOR004W 765 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 CYC2YOR037W 1101 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 SAM4YPL273W 978 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 SHE3YBR130C 1278 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 EFT2YDR385W 2529 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 EFT1YOR133W 2529 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 MPA43YNL249C 1629 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 ILV1YER086W 1731 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 COT1YOR316C 1320 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 SHU2YDR078C 672 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 ILM1YJR118C 612 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 FPR3YML074C 1236 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 NIS1YNL078W 1224 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 RPS3YNL178W 723 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 YBR012CYBR012C 420 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 TMA16YOR252W 537 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 MRPL40YPL173W 894 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 VID24YBR105C 1089 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 MRPL27YBR282W 441 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 RIX7YLL034C 2514 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 KTR5YNL029C 1569 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 GUD1YDL238C 1470 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 YFL042CYFL042C 2025 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 GCD1YOR260W 1737 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 NTA1YJR062C 1374 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 GPD1YDL022W 1176 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 KEI1YDR367W 666 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 DIG2YDR480W 972 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 PRP18YGR006W 756 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 YGR160WYGR160W 612 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 OM45YIL136W 1182 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 APN1YKL114C 1104 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 YML084WYML084W 309 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 MRPS18YNL306W 654 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 PCL8YPL219W 1479 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 CLB2YPR119W 1476 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 SEC18YBR080C 2277 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 MKS1YNL076W 1755 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 TRM82YDR165W 1335 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 NKP1YDR383C 717 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 ISC10YER180C 804 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 GTR2YGR163W 1026 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 TIM10YHR005C-A 282 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 CAP1YKL007W 807 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 GPX1YKL026C 504 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 YOL029CYOL029C 606 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 YOR314WYOR314W 330 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 YPL077CYPL077C 723 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 GLN1YPR035W 1113 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 HXK2YGL253W 1461 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 UBP9YER098W 2265 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 POP1YNL221C 2628 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 NPL4YBR170C 1743 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 YDR387CYDR387C 1668 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 snR82snR82 268 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 YDR366CYDR366C 399 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 GCG1YER163C 699 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 RPL7AYGL076C 735 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 PEX21YGR239C 867 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 URA1YKL216W 945 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 YLR101CYLR101C 396 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 TFS1YLR178C 660 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 CUE5YOR042W 1236 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 RPL7BYPL198W 735 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 RPO26YPR187W 468 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 MTC5YDR128W 3447 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 PAT1YCR077C 2391 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 MIC60YKR016W 1623 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 PLB3YOL011W 2061 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 GRX3YDR098C 858 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 YDR271CYDR271C 372 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 AGA2YGL032C 264 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 ARP1YHR129C 1155 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 RPE1YJL121C 717 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 YAR047CYAR047C 321 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 MAP2YBL091C 1266 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 MRPS12YNR036C 462 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 COS10YNR075W 1125 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 SGF29YCL010C 780 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 CYS4YGR155W 1524 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 RAD18YCR066W 1464 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 GYP8YFL027C 1494 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 MET17YLR303W 1335 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 SYM1YLR251W 594 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 YLR252WYLR252W 306 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 WRS1YOL097C 1299 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 LEE1YPL054W 906 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 MRPS9YBR146W 837 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 CTS2YDR371W 1536 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 MFB1YDR219C 1398 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 IMA3YIL172C 1770 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 IMA4YJL221C 1770 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 TRM13YOL125W 1431 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 ARG82YDR173C 1068 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-NL1Q12391 HMO1YDR174W 741 nt5.51□□□□□ -1.53
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