Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 RPL14AYKL006W 417 nt3.93□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 PER33YLR064W 822 nt3.93□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 MFM1YPL060W 1242 nt3.93□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 EFM2YBR271W 1260 nt3.93□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 YDR444WYDR444W 2064 nt3.93□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 RGP1YDR137W 1992 nt3.93□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 PUT2YHR037W 1728 nt3.92□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 SMF1YOL122C 1728 nt3.92□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 UPC2YDR213W 2742 nt3.92□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 GAS2YLR343W 1668 nt3.92□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 LPP1YDR503C 825 nt3.92□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 YHR112CYHR112C 1137 nt3.92□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 SRN2YLR119W 642 nt3.92□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 MAP1YLR244C 1164 nt3.92□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 OPT2YPR194C 2634 nt3.92□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 TOG1YER184C 2385 nt3.91□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 CHL1YPL008W 2586 nt3.91□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 DAS2YDR020C 699 nt3.91□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 RRP1YDR087C 837 nt3.91□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 YGR079WYGR079W 1113 nt3.91□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 YRA2YKL214C 612 nt3.91□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 YKR075CYKR075C 924 nt3.91□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 YLL017WYLL017W 312 nt3.91□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 YPR059CYPR059C 387 nt3.91□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 TPA1YER049W 1935 nt3.91□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 VPS73YGL104C 1461 nt3.91□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 PRP31YGR091W 1485 nt3.91□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 HCM1YCR065W 1695 nt3.9□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 NUP133YKR082W 3474 nt3.9□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 MST1YKL194C 1389 nt3.9□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 FMP30YPL103C 1407 nt3.9□□□□□ -1.78
RRP42Q12277 DPB4YDR121W 591 nt3.9□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 SAE3YHR079C-A 276 nt3.9□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 YMR130WYMR130W 909 nt3.9□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 YPR015CYPR015C 744 nt3.9□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 PMC1YGL006W 3522 nt3.9□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 YOL075CYOL075C 3885 nt3.9□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 TRF5YNL299W 1929 nt3.89□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 ULS1YOR191W 4860 nt3.89□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 POL12YBL035C 2118 nt3.89□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 SAT4YCR008W 1812 nt3.89□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 RPS11AYDR025W 471 nt3.89□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 ENT5YDR153C 1236 nt3.89□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 NBP2YDR162C 711 nt3.89□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 ISA1YLL027W 753 nt3.89□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 SLX1YBR228W 915 nt3.89□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 RCM1YNL022C 1473 nt3.89□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 SEC2YNL272C 2280 nt3.89□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 CDC6YJL194W 1542 nt3.89□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 KRE29YER038C 1395 nt3.89□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 YPK9YOR291W 4419 nt3.88□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 SSH1YBR283C 1473 nt3.88□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 PXR1YGR280C 816 nt3.88□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 VMA22YHR060W 546 nt3.88□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt3.88□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 NSE1YLR007W 1011 nt3.88□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 RPS31YLR167W 459 nt3.88□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 POP3YNL282W 588 nt3.88□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 RPS19AYOL121C 435 nt3.88□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 PMT4YJR143C 2289 nt3.87□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 TAF7YMR227C 1773 nt3.87□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 HMG1YML075C 3165 nt3.87□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 ATP5YDR298C 639 nt3.87□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 PFA5YDR459C 1125 nt3.87□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 UBC8YEL012W 657 nt3.87□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 YGL199CYGL199C 471 nt3.87□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 YKR047WYKR047W 306 nt3.87□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 SKG1YKR100C 1068 nt3.87□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 YLR374CYLR374C 390 nt3.87□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 YLR402WYLR402W 192 nt3.87□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 EOS1YNL080C 1101 nt3.87□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 YBR219CYBR219C 384 nt3.87□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 TCO89YPL180W 2400 nt3.87□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 TYW1YPL207W 2433 nt3.87□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 KTR7YIL085C 1554 nt3.87□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 ENT1YDL161W 1365 nt3.87□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 TCM62YBR044C 1719 nt3.87□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 PRM2YIL037C 1971 nt3.86□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 YBR225WYBR225W 2703 nt3.86□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 HSP30YCR021C 999 nt3.86□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 RPP1AYDL081C 321 nt3.86□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 IRC22YEL001C 678 nt3.86□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 MOB2YFL034C-B 864 nt3.86□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 ERV14YGL054C 417 nt3.86□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 TYS1YGR185C 1185 nt3.86□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 YIL152WYIL152W 708 nt3.86□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt3.86□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt3.86□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 VHS3YOR054C 2025 nt3.86□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 PSY4YBL046W 1326 nt3.86□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 FAS2YPL231W 5664 nt3.86□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 TFA1YKL028W 1449 nt3.86□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 MTR10YOR160W 2919 nt3.85□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 YDR230WYDR230W 348 nt3.85□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 MMS21YEL019C 804 nt3.85□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 BUD16YEL029C 939 nt3.85□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 COX4YGL187C 468 nt3.85□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 PRE9YGR135W 777 nt3.85□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 YBL059WYBL059W 582 nt3.85□□□□□ -1.79
RRP42Q12277 RPL18BYNL301C 561 nt3.85□□□□□ -1.79
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