Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 RCK2YLR248W 1833 nt4.64□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 Q0255Q0255 1419 nt4.63□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 MAK11YKL021C 1407 nt4.63□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 TRM13YOL125W 1431 nt4.63□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 TUP1YCR084C 2142 nt4.63□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 ARN1YHL040C 1884 nt4.63□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 RRP8YDR083W 1179 nt4.63□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt4.63□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 PDX3YBR035C 687 nt4.63□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 HAT1YPL001W 1125 nt4.63□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 YPL278CYPL278C 303 nt4.63□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 MKS1YNL076W 1755 nt4.63□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 GAS5YOL030W 1455 nt4.62□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 STE20YHL007C 2820 nt4.62□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 CLF1YLR117C 2064 nt4.62□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 SNA2YDR525W-A 240 nt4.62□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 GRX4YER174C 735 nt4.62□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 YGR149WYGR149W 1299 nt4.62□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt4.62□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 RFC2YJR068W 1062 nt4.62□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 CPR3YML078W 549 nt4.62□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 ERG29YMR134W 714 nt4.62□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 RCE1YMR274C 948 nt4.62□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 REX4YOL080C 870 nt4.62□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 IZH4YOL101C 939 nt4.62□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 CNS1YBR155W 1158 nt4.62□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 APA1YCL050C 966 nt4.62□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 TRM1YDR120C 1713 nt4.62□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 CPS1YJL172W 1731 nt4.62□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 TFC7YOR110W 1308 nt4.62□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 YPS7YDR349C 1791 nt4.62□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 MDM38YOL027C 1722 nt4.61□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 DNF2YDR093W 4839 nt4.61□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 CPR4YCR069W 957 nt4.61□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt4.61□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 COA3YJL062W-A 258 nt4.61□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 GAB1YLR459W 1185 nt4.61□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 MAP2YBL091C 1266 nt4.61□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 YOR097CYOR097C 528 nt4.61□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 SLS1YLR139C 1932 nt4.61□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 HSE1YHL002W 1359 nt4.61□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 LDB17YDL146W 1476 nt4.61□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 OCT1YKL134C 2319 nt4.61□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 MNN4YKL201C 3537 nt4.6□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 GAD1YMR250W 1758 nt4.6□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 DPH6YLR143W 2058 nt4.6□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 YER084WYER084W 387 nt4.6□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 PEX14YGL153W 1026 nt4.6□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt4.6□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 YAR061WYAR061W 204 nt4.6□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 ROT1YMR200W 771 nt4.6□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 YPR071WYPR071W 636 nt4.6□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 YBR219CYBR219C 384 nt4.6□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt4.6□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 SRO9YCL037C 1305 nt4.6□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 DBP5YOR046C 1449 nt4.6□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 NMD3YHR170W 1557 nt4.6□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 AZR1YGR224W 1842 nt4.6□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 KRE6YPR159W 2163 nt4.6□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 NUR1YDL089W 1455 nt4.59□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 ARG82YDR173C 1068 nt4.59□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 PLP1YDR183W 693 nt4.59□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 FOX2YKR009C 2703 nt4.59□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 EAF7YNL136W 1278 nt4.59□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 AKL1YBR059C 3327 nt4.59□□□□□ -1.67
LCB4Q12246 MNT2YGL257C 1677 nt4.58□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 WTM2YOR229W 1404 nt4.58□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 ZRT1YGL255W 1131 nt4.58□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 LNP1YHR192W 837 nt4.58□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 YBL010CYBL010C 843 nt4.58□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 HLJ1YMR161W 675 nt4.58□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 YNL171CYNL171C 369 nt4.58□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 MRP21YBL090W 534 nt4.58□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 ICY2YPL250C 411 nt4.58□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 AFT1YGL071W 2073 nt4.58□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 ARG4YHR018C 1392 nt4.57□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 TSL1YML100W 3297 nt4.57□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 STR2YJR130C 1920 nt4.57□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 CPR1YDR155C 489 nt4.57□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 RMR1YGL250W 726 nt4.57□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 ERG20YJL167W 1059 nt4.57□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 AAD10YJR155W 867 nt4.57□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 YAL069WYAL069W 315 nt4.57□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 SMD3YLR147C 306 nt4.57□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 UPS2YLR168C 693 nt4.57□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 SHE1YBL031W 1017 nt4.57□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 RPL15BYMR121C 615 nt4.57□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 TMA16YOR252W 537 nt4.57□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 SFG1YOR315W 1041 nt4.57□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 SPO19YPL130W 672 nt4.57□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 SHE3YBR130C 1278 nt4.57□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 IMA1YGR287C 1770 nt4.57□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 RAD28YDR030C 1521 nt4.56□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 ECM18YDR125C 1362 nt4.56□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 MSC2YDR205W 2175 nt4.56□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 YGL177WYGL177W 348 nt4.56□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 YGL185CYGL185C 1140 nt4.56□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 YGR079WYGR079W 1113 nt4.56□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 CUP1-1YHR053C 186 nt4.56□□□□□ -1.68
LCB4Q12246 CUP1-2YHR055C 186 nt4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.1 ms